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La France compte 23 plateformes maladies rares labellisées : 19 plateformes d'expertise maladies rares (PEMR) en métropole et 4 plateformes de coordination outre-mer (PCOM). Elles ont pour mission de coordonner les parcours de soins, de mutualiser les expertises locales et d'accompagner les patients et leurs proches.
L'APPF participe notamment aux activités de la Plateforme d'expertise maladies rares Paris Nord.
Créés en 2017, les 24 réseaux européens de référence (ERN) réunissent des centres spécialisés dans les maladies rares et complexes. Ils favorisent la coopération entre professionnels de santé, le partage des connaissances et l'amélioration de la prise en charge des patients à l'échelle européenne.
ERN-Skin est le réseau consacré aux maladies rares de la peau, notamment les maladies bulleuses auto-immunes.